Eu geralmente encaro isso quando meu computador fica inativo por dias e não limpo minha pasta de miniaturas.
o que eu faço é executar este comando para excluir visualizações antigas e forçar a geração de novas.
rm ~/.cache/thumbnails/ -R
desde que eu trabalho com um monte de imagens eu adicionei uma linha no meu crontab para fazê-lo a cada 5 minutos.
crontab -e
eu adiciono
*/5 * * * * rm ~/.cache/thumbnails/ -R