O programa está lhe dizendo simplesmente que irá remover a entrada do gerenciador de inicialização para o sistema operacional que está removendo. É suposto fazer isso. No entanto, prossiga com cuidado (faça o backup de todos os arquivos necessários), pois as operações do carregador de inicialização, se feitas de maneira errada, podem danificar o seu gerenciador de inicialização e tornar o sistema não inicializável.