Ao criar novos aplicativos HTML5, verifique se você tem uma versão recente do ubuntu-html5-container e do ubuntu-html5-ui-toolkit. Eu recomendo que você pegue a versão 0.1.2 + 14.04.20140219-0ubuntu1 ~ ubuntu13.10.1 ~ ppa1 ou mais recente.
Em particular, assegure-se de que os arquivos do seu aplicativo estejam localizados no diretório www (arquivos index.html e JS), pois recentemente tivemos que mudar as coisas para esse diretório, para acomodar o tempo de execução opcional do cordova.
O aplicativo e o container Skeleton do Ubuntu HTML5 foram sincronizados para funcionar dessa maneira. Para migrar de um modelo anterior, basta mover os arquivos para www. Você pode deixar os arquivos de configuração como manifestos e arquivos json na raiz do diretório.
Por fim, os eventos de foco podem não estar disponíveis no momento devido à visualização da Web que estamos usando (QtWebkit, com um viés admitido em relação aos aplicativos de toque). Este é um bug para o caso de convergência, então, por favor, registre um no launchpad.net/ubuntu-htm5-theme (que ainda é o pacote fonte para nosso toolkit HTML5 principal). Obrigado