No Ubuntu 13.10 / 13.04 / 12.10 e no Ubuntu 12.04, o login definido pelo usuário ou o login raiz da GUI é desativado por padrão. Você pode ativar o login definido pelo usuário modificando o arquivo de configuração lightdm. Uma vez que o login manual está habilitado, é fácil fazer login como root na GUI.
Para ativar o login manual no Ubuntu 13.10 13.04 12.10 12.04
Abra um Terminal e execute o seguinte comando: Emita a senha para o usuário quando solicitado.
echo "greeter-show-manual-login=true" | sudo tee -a /etc/lightdm/lightdm.conf
Agora defina / altere a senha do usuário raiz em sua máquina.
Para definir / alterar a senha do root, execute o seguinte comando no terminal e emita a senha para o usuário, quando solicitado.
sudo passwd
Digite a senha duas vezes. Depois de criar a senha, reinicie o sistema.
Agora você pode encontrar a opção de login manual na lista de login. Selecione Login e digite o nome do usuário como root e forneça a senha raiz que você criou.
Espero que isso seja útil para você !!!