No meu caso, quando eu tinha chown'd corretamente os diretórios, de alguma forma eu acabei tendo isso acontecendo ao fazer um ls -la de /
lrwxrwxrwx 1 root root 11 Jun 13 01:44 tools -> tools/
Uma vez que eu completei o seguinte, eu fui capaz de descompactar bin-utils e seguir meu caminho para fazer o LFS.
sudo su
cd /
rm tools
ln -s /mnt/tools/ tools