A solução que acabei usando foi criar um novo usuário e configurar essa conta com o gnome-classic e depois renomear o usuário antigo para user_old e renomear meu novo usuário para o nome original dos usuários. E, em seguida, faça um monte de movimentos de arquivos e chowns para restaurar a conta ao estado anterior.
Não é realmente uma ótima solução. Mas o método "compiz --replace" acabou por criar mais problemas