É o padrão do miniaplicativo do indicador para agrupar os indicadores do aplicativo e do sistema separadamente e colocar os indicadores do aplicativo à esquerda dos indicadores do sistema, portanto, é provável que você precise de um applet de host modificado para fazer isso.
Veja a especificação para maiores informações, e você também pode pedir ajuda no #ayatana no Freenode.