Você deve dar uma olhada em quais programas instalados estão sendo executados em segundo plano após o login e remover os que você não precisa. Os programas ainda estarão instalados, mas só serão executados quando você precisar deles. Em um terminal, digite:
gnome-session-properties
Você verá algo assim:
Não desabilite nenhum programa antes de saber que é seguro (pesquise os nomes na Web para ver qual é a função deles).
Mais itens que você pode desativar, mas desta vez serviços. Em um terminal:
sudo apt-get install rcconf
sudo rcconf
Mais uma vez, estes não são programas, mas serviços (daemons no GNU / Linux), então pesquise na web para ver quais deles você pode desativar com segurança. Por exemplo, eu não tenho uma impressora nem um modem, então eu sempre desabilito o CUPS e o modem-manager.
Outra coisa, instale o pré-carregamento, um utilitário que carrega bibliotecas na memória de acordo com a frequência com que você as usa:
sudo apt-get install preload
E é isso, o programa será executado em segundo plano, você não precisa configurá-lo nem nada.
Espero que ajude!