A maneira mais fácil de instalar o Cairo Dock é iniciar o Centro de Software e procurar pelo Cairo. Isso instalará o software como deveria. Então você pode configurá-lo como você quer configurar, isso quase me comprou às lágrimas :)
Uma vez que esteja configurado e funcionando e como você quer que seja, se você quiser jogar com o Terminal, dê uma olhada em alguns dos comandos que estão disponíveis para você aqui