Você provavelmente só editou as configurações do usuário, não do sistema inteiro. Se este for o caso, uma reinstalação do Nautilus em todo o sistema não ajudará a resolver o problema. Todas as alterações no menu devem ser armazenadas na pasta ~ / .local / share / applications - verifique a pasta se encontrar algum arquivo com "nautilus" ou "arquivos" no nome. Tente mover este arquivo para uma pasta diferente (para copiá-lo de volta, se for o errado). Na pior das hipóteses, mova todos os arquivos de ~ / .local / share / applications para um local diferente e copie-os novamente, um por um, até encontrar a entrada que está causando problemas. Pode ser necessário aguardar alguns segundos para que as alterações nessa pasta sejam aplicadas ou você pode até mesmo fazer logout e voltar novamente.
Além disso, existe uma pasta chamada ~ / .local / share / mime / applications que contém configurações de associação de tipo de arquivo que foram alteradas a partir do padrão do sistema.