O turbo não prejudica o seu computador, você pode encontrar alguma evidência disso?
O Turbo faz o overclock da cpu por um curto período de tempo, então se você tiver um cooler com cpu ruim, isso pode ter um efeito negativo, mas um cooler com cpu ruim deve ser substituído. Você deve sempre usar o turbo a menos que a temperatura da CPU esteja muito alta (perto do valor máximo).
Além disso, os discos rígidos melhoraram muito desde o lançamento do Windows 98. A desfragmentação e o teste de desempenho também não são os mesmos, a desfragmentação gira em torno dos arquivos e o teste de desempenho maximiza o disco rígido.