O Discord permanece aberto como um aplicativo em segundo plano com um ícone na bandeja do sistema. A extensão "appindicators do Ubuntu", que é responsável por mostrar esses ícones, não mostra muitos ícones de aplicativos, especialmente aplicativos baseados em elétrons.
Você pode instalar a extensão TopIcons Plus para mostrar o ícone da Discórdia.