configure
é um script (arquivo) localizado na árvore de origem de uma distribuição de origem. Não há substituto para isso no Ubuntu 13.10, se a fonte for a mesma, ainda funcionará.
Certifique-se de que você navegou para a árvore de origem de um projeto. Exemplos de instruções que ainda são aplicáveis:
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Fonte de download.
wget http://bumblebee-project.org/bumblebee-3.2.1.tar.gz
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Extrair fonte.
tar xf bumblebee-3.2.1.tar.gz
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Digite a árvore de origem extraída.
cd bumblebee-3.2.1
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Execute o script
configure
:./configure --help