O Ubuntu One é uma ferramenta de sincronização, não uma ferramenta de backup. O princípio de sincronização é que todos os computadores possuem os mesmos arquivos. O princípio de fazer backup dos dados é manter os dados armazenados em caso de emergência.
No Ubuntu One, todos os arquivos que você excluir em seu computador local serão imediatamente excluídos da versão em nuvem de seus dados.
As soluções de backup baseadas no Ubuntu One não são perfeitas. Aqui estão duas opções que você pode considerar, embora eu recomende contra elas:
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Você pode adicionar uma pasta ao Ubuntu One. Uma vez que a pasta esteja sincronizada com a nuvem, você pode decidir parar de sincronizá-la em sua máquina local (desmarque-a na interface do Ubuntu One). Isso é propenso a erros.
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Você também pode fazer backups localmente e armazená-los na nuvem do Ubuntu One. Novamente, no entanto, se você excluir o backup localmente, a nuvem seguirá porque é isso que as nuvens fazem.