Editar:
Você pode querer remover o que você instalou porque isso pode entrar em conflito com o que o eclipse quer puxar para baixo.
Por que você gostaria de rodar o netbeans em um linux? O Netbeans é projetado principalmente para windows, e embora eles "suportem" o linux (de acordo com eles), essas coisas não funcionam realmente.
Minha recomendação para você é usar o eclipse. Em um terminal:
apt-get install eclipse
E isso fará o download de tudo o que é necessário para o desenvolvimento de java. (Também em uma nota pessoal: o gerenciamento do espaço de trabalho do Eclipse faz mais sentido do que o do netbeans.)