O problema é, na verdade, o Windows e não o Linux. A Microsoft escreveu seu sistema para tentar roubar o computador como um todo de qualquer outro sistema operacional. Várias atualizações do Windows (eu estou supondo que você tem atualizações automáticas ativadas para o Windows?) Vai tentar matar o bootloader GRUB.
Embora existam maneiras de software em torno disso (como a reinstalação do Ubuntu), minha sugestão pessoal para evitar isso continuamente é adicionar um segundo disco rígido interno ao seu computador. (Isso é muito melhor para a estabilidade do sistema! Um disco rígido para cada sistema operacional e um disco rígido "documentos e mídia" onde você armazena seus arquivos, fotos, filmes, etc. Isso geralmente garante que se algo morre terrivelmente, você não estará completamente perdido, especialmente porque qualquer grande erro que aconteça normalmente acontecerá no disco rígido do sistema operacional.) Então, você pode evitar o GRUB e as substituições do Windows inteiramente, mas apenas pressionando o BIOS do seu computador. chave ao inicializar e apenas alterar qual unidade você está usando.