O download normal do Ubuntu que não é o Wubi é instalado em uma nova partição. Como quase todas as outras distribuições Linux, como Red Hat, Debian, etc, ele irá procurar por qualquer outro sistema operacional, como o Windows, e criar uma configuração de boot duplo para todos eles.
Mas esteja ciente de que, depois de instalar qualquer um deles, você não poderá simplesmente apagá-lo, porque o arquivo de configuração de inicialização é o último instalado. Se você excluí-lo, o Windows não inicializará, a menos que você restaure o carregador de boot usando o disco de inicialização original do Windows ou um utilitário de terceiros.