Eu acho que você quer dizer 'ecryptfs'. eCryptfs é um programa para criptografar partições e diretórios. Aparentemente, a criptografia da sua pasta pessoal leva um certo impacto no desempenho da sua CPU.
Em geral, achei mais útil criptografar algumas pastas do que o / home inteiro. / home contém muitos arquivos de configuração que são acessados o tempo todo por vários programas, e cada acesso faz o ecryptfs funcionar.
Dito isso, ainda acho que o uso da CPU que você informa é muito alto.