Parece ser um problema de codificação de texto entre o Windows & amp; Ubuntu. Existe um utilitário que converte a codificação de arquivos para o estilo unix / dos chamado dos2unix. (As ferramentas complementares são unix2dos).
sudo apt-get install dos2unix
dos2unix filename.txt
Ele irá converter os finais de linha do Windows para o estilo Unix.
Como alternativa, você pode simplesmente criar um novo arquivo usando o gedit e colar o conteúdo. O Gedit salvá-lo com os finais de linha corretos. (CR, em vez de CRLF)