No Ubuntu 12.04 você pode fazer isso na seção de aparência das configurações do sistema.
Na parte inferior, há um controle deslizante para alterar o tamanho do ícone do lançador.
Não consegui alterar o tamanho do ícone do iniciador do ccsm, acho que configurei a parte conforme segui passos neste link
Mas após o logout / in novamente, o tamanho do ícone não diminuiu.
Estou executando o mais recente Ubuntu 12.04
No Ubuntu 12.04 você pode fazer isso na seção de aparência das configurações do sistema.
Na parte inferior, há um controle deslizante para alterar o tamanho do ícone do lançador.