Eu configurei todos os meus pacotes "manualmente instalados" como "instalados automaticamente". Agora o apt-get está dizendo que vários pacotes não são necessários, e sugere usar o apt-get autoremove para se livrar deles. Claro que eu quero manter esses pacotes e me livrar da mensagem, então eu suponho que eu precise revertê-los de volta ao status anterior de instalação manual.
Eu não posso fazer isso um por um, porque eles são muitos.
Como eu poderia fazer isso?
Basta fazer um apt-get install <packagename> para cada um dos pacotes afetados. Eles não serão mais recomendados para "autoremove".
Tenha em mente: "instalação automática" significa que você não os solicitou explicitamente, mas eles foram extraídos por dependências (algum outro pacote declarou que precisava deles). Então, se não houver mais um pacote que precise dele e você nunca o quis em primeiro lugar, o apt o considera "obsoleto".