Bem, se você clicar no botão errado, poderá corrigi-lo clicando no botão certo. Literalmente. No Windows, o botão fechar está à direita e o botão minimizar está à esquerda. Como o Ubuntu tem esses controles no lado esquerdo da janela, o botão fechar está à esquerda e o botão minimizar está à direita.
É possível que você esteja apenas clicando no botão errado? É a única explicação imediata que posso pensar.