A maioria das "BIOS RAID" embutidas nas placas-mãe são na verdade um RAID de software, não um verdadeiro RAID de hardware, e é por isso que o Ubuntu não o vê.
O que eu tentaria fazer é fazer backup de sua configuração de RAID, todos os seus dados, etc. Em seguida, tente recriar a configuração de RAID com o Ubuntu usando o mdadmin.
Por isso, não quero dizer começar de novo, mas configurar o mdadmin para replicar sua configuração de raid existente e instalar o Ubuntu nessa outra partição que você deseja criar. Pode ser possível configurar o RAID do software Linux para imitar o "BIOS RAID", você pode realmente usar as duas janelas e o Linux nesta configuração de RAID.
Se você quer que uma solução realmente funcione, você precisa comprar uma placa RAID de hardware real, normalmente são US $ 200,00.