Tenho um notebook Sony Z11 com 2 placas de vídeo, Intel & amp; nVidia. VMWare Player + Ubuntu + A Unity 3d (compiz) funciona muito bem na nVidia (mais rápida), enquanto a Intel mostra exatamente os mesmos sintomas da sua. Eu não tenho isso funcionando na Intel, mas esse fato mostra que o problema pode estar na incompatibilidade do driver de vídeo do sistema operacional host com o convidado do VMWare Player / Ubuntu. Talvez você possa tentar atualizar o driver de vídeo do host para a versão mais recente.
Minha configuração do sistema:
Notebook: Sony VPC-Z1190X
Host OS: Windows 7 Ultimate 64-bit
Videocard 1: NVidia GeForce GT 330M / Driver 190.24
Videocard 2: Intel GMA HD / Video BIOS 2120.0 / Driver 8.15.10.2021
VMWare: Player 4.0.3
Ubuntu: 12.04 64-bit
Unity/Compiz: latest from repository.