Você não pode sincronizar uma pasta fora do seu diretório pessoal diretamente com o Ubuntu One. No entanto, se você está procurando salvar o conteúdo de (digamos) / var / www no Ubuntu One para fazer o backup, e você está usando o Ubuntu, então dê uma olhada no Déjà Dup, que você pode instalar a partir do Centro de Software; Ele permite que você faça o backup de qualquer pasta que você queira para o Ubuntu One e, em seguida, restaure-as se for necessário.