Eu tenho 11.10 instalado e desativei os efeitos animados do Compiz, mas ativei janelas instáveis. Então, em suma, as janelas não se desvanecem / deslizam / etc, mas elas oscilam.
Não consigo encontrar um padrão, mas parece que enquanto estou trabalhando por algumas horas, as janelas tremidas de repente param de ser vacilantes sem razão. Apenas em algumas janelas, lembre-se.
Obviamente, não é esperado comportamento ...
Acho que há algum programa / script no seu computador alterando o gerenciador de janelas atual. Quando as janelas não estiverem mais bambas, abra um terminal e tente compiz --replace . Se isso funcionar, você deve encontrar o que está mudando o gerenciador de janelas e impedi-lo de substituí-lo.