Claro que você pode usar o Gnome Schedule para definir qualquer atividade a ser executada no horário que desejar.
Está no repositório oficial:
% bl0ck_qu0te%ou verifique na USC.
Em seguida, inicie-o e crie uma nova tarefa que seja lançada de forma recorrente.
Você pode adicionar uma descrição e 'update-manager' como comando, finalmente em tempo e data avançados que você pode definir quando iniciar sua tarefa com precisão.
Espero que possa ser útil para outras tarefas também.
Obviamente, você precisou definir o Gerenciador de Atualizações para nunca verificar atualizações em seu próprio menu de configurações ou não irá parar para aparecer.