Você pode fazer o que é chamado de "instalação suja", já que você já tem uma partição separada para / home. Quando o instalador exibir o aplicativo de particionamento, instrua-o para não reformatar a partição onde reside o / home. Ele fará uma instalação completa, mas não substituirá / home.
Em seguida, você ainda precisará reinstalar seus aplicativos, mas a maioria das configurações e outras configurações permanecerão intactas. Eu já fiz isso antes e funciona muito bem.