Você não pode desabilitar ícones no momento, a menos que queira excluir todos os seus conjuntos de ícones (você não o faz). Mas os ícones não são o que está retardando o seu traço. A principal causa é o desfoque no fundo do traço, que pode causar um segundo atraso. Por meio de compiz config (ccsm), você pode desativar o desfoque ou configurá-lo para estático.
Desativar o desfoque torna o traço mais rápido, mas pode dificultar a leitura do texto do traço. O blur estático é novamente mais rápido que o blur ativo, a única diferença é que a imagem por trás do tablier não muda (por exemplo, se um pop-up aparecer por algum tempo o traço é aberto, você não o verá atrás.
Eu recomendo vivamente que você tente as opções de desfoque. Também use 12.04, a unidade é muito mais rápida! O Unity 2D também oferece um bom aumento de velocidade.