Você pode instalar o desktop padrão do Ubuntu diretamente na configuração do Mythbuntu fazendo
sudo apt-get install ubuntu-desktop
Então você pode até mesmo desinstalar os pacotes relacionados ao mythbuntu se não precisar deles.
No entanto, não acho que isso vai resolver seus problemas com o Samba. Para isso, a verificação dos registros do samba pode fornecer algumas informações.