Geralmente isso acontece se você estiver tentando instalar em um 'disco' dinâmico.
Agora, o Win7 oferece a conversão para discos dinâmicos quando você já tem 4 partições primárias e tenta criar outra. Infelizmente, esse processo não é facilmente reversível e essas partições não são visíveis para o Linux, pois não estão na tabela de partições do MBR.
Na verdade, esse erro não é o Wubi, é o Windows impedindo que você inicialize diretamente da partição dinâmica. Funcionaria se você escolhesse C: mas não faça isso - rodar o linux em um disco com partições dinâmicas pode levar à perda de dados (já que eles não são visíveis para o Ubuntu).
Aqui está um tópico em que o pôster foi convertido de dinâmico de volta para simples: link