Se você tiver uma versão anterior do Ubuntu (não 11.10), clique com o botão direito do mouse no arquivo, selecione Propriedades e, na guia Abrir com, você pode pesquisar a opção para gravar seu aplicativo personalizado. Por exemplo, se você sabe que o Microsoft Word pode abrir um documento usando esta linha (eu não uso o msword, então eu realmente não sei se o comando follow funcionará, é apenas um exemplo):
wine msword mydoc
você coloca essa linha na caixa do aplicativo personalizado.
Se você estiver usando 11.10, isso não é possível ( porque ? ), então você deve procurar this . Dessa forma, você pode adicionar qualquer aplicativo à opção Abrir com, incluindo vinho.
Espero que ajude.
Atenciosamente,