Não tenho certeza se o Minecraft tem suporte nativo a gamepad, mas você deve ser capaz de fazê-lo funcionar via emulação de mouse / teclado via qjoypad ou xboxdrv .
O controlador de gamepad Logitech funciona no Ubuntu 11.04, mas não funciona com o Minecraft. Eu tentei Minecontrol que suporta windows / mac / linux e é usado para fazer Minecraft compatível com um controlador USB no entanto, não é possível localizar o controlador USB. Alguma sugestão?