Experimente gtk-vector-screenshot . De acordo com as especificações, ele só pode fazer capturas de tela de aplicativos GTK3, mas talvez você tenha sorte. Eu usei há algum tempo e estava tudo bem.
Você pode instalá-lo por:
sudo apt-get install gtk-vector-screenshot
e execute-o por:
take-vector-screenshot
Algumas fontes também dizem que você deve fazer logout e login novamente antes de poder usá-lo.