Eu acho que você está descrevendo um sistema de arquivos básico de sobreposição, como o uso do ISO ao vivo. Que tal apenas:
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use um ISO / USB ativo com todas as alterações no RAM e reinicialize para "redefinir"
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Ou use a persistência para salvar as alterações durante as reinicializações e apague os arquivos persistentes para "redefinir"
Você sempre pode usar um sistema de arquivos de sobreposição diretamente, mas os ISOs já estão bem configurados & amp; pronto para rolar. Veja alguns links de informações / ajuda de sobreposição: