Aqui está uma solução que acho que pode ajudar. Existe um programa chamado "MyUnity" e foi projetado para permitir que você personalize o Unity mais do que seria possível com o gerenciador de configurações padrão. Há uma configuração nesse programa para alterar o tamanho do traço. Pelo que li on-line, há uma configuração que maximiza o traço para qualquer tamanho de tela que você tenha. Há também uma configuração que nunca maximiza o traço.
Você pode instalá-lo com o seguinte comando do terminal:
sudo apt-get install myunity
Quando o MyUnity estiver instalado, abra-o e clique na guia "traço" na parte superior da janela. A última opção é para o tamanho do traço. "Automatic" é obviamente a configuração padrão, e eu acho que é isso que está causando o comportamento indesejável atual para você. "Netbook" é aquele que maximiza o traço para qualquer tamanho de tela que você está usando, e "Desktop" é a configuração que torna o traço um tamanho fixo que é menor que o tamanho da tela.
Por favor, deixe-me saber se isso resolveu seu problema.