Uníssono
O Unison é uma ferramenta GUI e baseada em terminal que permite que arquivos e diretórios sejam mantidos em sincronia uns com os outros, entre diferentes diretórios locais e unidades ou em uma rede, o que poderia estar em sistemas operacionais diferentes. O aplicativo está disponível para sistemas operacionais Unix (Linux e Mac OS X) e Windows. As alterações podem ser feitas nos diferentes locais, e o Unison atualizará as máquinas com as versões corretas de arquivos e pastas, copiando, excluindo, renomeando ou excluindo arquivos e diretórios conforme necessário.
O aplicativo de sincronização Unison é provavelmente o mais usado e confiável pela comunidade Ubuntu / Debian. Está disponível no Centro de Software e no gerenciador de pacotes. Tem uma linha de comando e uma interface gráfica de usuário (GUI) (GTK).
Unison Homepage
Wiki da comunidade de ajuda do Ubuntu - Unison
Um exemplo de uso curto, próximo ao seu pedido, pode ser encontrado em Resposta do Rmano (captura de tela abaixo).
FreeFileSync
FreeFileSync é um software gratuito de backup de dados que ajuda a sincronizar arquivos e sincronizar pastas. Ele foi projetado para economizar o seu tempo configurando e executando backups de dados enquanto você tem um bom feedback visual ao longo do caminho. O FreeFileSync é um software de código aberto disponível para Windows, Linux e macOS.
Eu nunca tentei, mas parece valer a pena. Ele tem uma GUI padrão e está em desenvolvimento ativo.
Página inicial do FreeFileSync
Synkron
Synkron é uma aplicação que ajuda a manter seus arquivos e pastas sempre atualizados. Você pode facilmente sincronizar seus documentos, músicas ou imagens para ter suas versões mais recentes em todos os lugares. O Synkron fornece uma interface fácil de usar e possui muitos recursos. Além disso, é gratuito, de código aberto e multiplataforma.