modprobe -r usb-storage
removerá o módulo usb-storage e, assim, desativará todos os dispositivos de armazenamento usb no sistema.
Para desativar os dispositivos de armazenamento usb permanentemente, coloque o módulo na lista negra com
echo "blacklist usb-storage" | sudo tee -a /etc/modprobe.d/blacklist.conf
(veja aqui )