Tanto quanto eu sabia, o wget geralmente baixa para o diretório de trabalho atual. Você tem as seguintes opções para especificar o diretório.
1.Alterar para o diretório que você deseja que seja baixado primeiro, em seguida, execute o comando wget.
cd /home/yourname/Downloads
Em seguida, execute seu comando wget
wget http://download.files.com/software/files.tar.gz
2.Adicione o diretório ao comando wget como este.
wget http://download.files.com/software/files.tar.gz -O /home/yourname/Downloads