Resposta curta: não, não faz diferença o que acontece com a CPU instalada no seu laptop.
Faz uma grande diferença o chip gráfico instalado, especialmente o que ele vai usar.
Em termos de tipo de CPU, RAM, disco rígido, esses não serão o problema. Os problemas virão de gráficos, chaves especiais de mídia, webcams integradas e dispositivos de som.
Um laptop AMD terá uma placa gráfica ATI embutida, você precisa ter certeza de que a placa esteja bem suportada pelo driver para Linux.
Um laptop Intel terá um Intel (que é suportado pelo driver incluído no Ubuntu) ou um cartão nVidia, que, no último caso, precisa ser verificado também para apoio de drivers .
A razão mais provável pela qual você está vendo muitos laptops baseados em Intel suportados pelo Ubuntu (ou Ubuntu) é provavelmente que não há drivers necessários para instalação imediata de um sistema com um chipset gráfico da Intel eo driver funciona todos os casos) muito bem com a Intel trabalhando duro no suporte ao Linux.
Procure um modelo de laptop que tenha um chipset gráfico bom e suportado, teclas de mídia especiais limitadas ou não (ou pelo menos procure suporte para elas antes de comprá-lo) e se você tiver uma webcam, verifique se há um driver e que você realmente não precisa instalar muitas coisas para funcionar.
Mas, em termos de CPU, você tem as mesmas chances (quase 0) de ter problemas por causa da CPU do laptop.