Como ByteCommander disse em um comentário, o PyCharm não usa o bashrc, então ele não sabe onde sua biblioteca está.
Na mesma tela em que você adicionou o intérprete você pode ver um ícone de roda, clique nele, ele mostrará um menu, clique em mais. Você deve ver uma tela como esta:
Você deve selecionar seu intérprete e clicar no último botão. Isso deve abrir esta janela:
Agora, clicando no ícone mais, você poderá adicionar seus próprios caminhos para bibliotecas.