Primeiro, verifique se o arquivo /etc/lightdm/lightdm.conf está lá. Se for, faça isso:
sudo passwd root
sudo sh -c 'echo "greeter-show-manual-login=true" >> /etc/lightdm/lightdm.conf'
O Root não aparece como usuário, mas o "Login", que é como você faz login manualmente com usuários não mostrados na tela de boas-vindas.
Reinicie e você poderá fazer o login como root.