Você pode ler uma breve descrição sobre os motivos no Ubuntu Wiki: link
Citação:
As primeiras versões do Ubuntu lançaram muitos utilitários gráficos para instalar e remover software: Adicionar / Remover Aplicativos, Synaptic Gerenciador de Pacotes, Gerenciador de Atualizações, Fontes de Software, apturl, GDebi e Zelador de computador. Esta redundância aumentou a quantidade de interface as pessoas tinham que aprender, espaço desperdiçado no CD do Ubuntu, fragmentado esforço de desenvolvimento, e tornou as pessoas mais propensas a pensar que Os métodos de instalação de software não sancionados eram seguros. Software Ubuntu Centro substitui Adicionar / Remover Aplicativos, Synaptic, apturl e GDebi, e atua como o principal ponto de entrada para fontes de software.
Além de fornecer um ponto central para instalar e remover software, A USC desempenha um papel pequeno, mas importante, no incentivo à aplicação desenvolvimento no Ubuntu, fornecendo aos desenvolvedores de aplicativos forma proeminente de oferecer seu software para instalação.