Eu enfrentei este cenário agora com vários programas: Eu costumava ter atalhos para iniciar meus aplicativos. O Visual Studio Code me disse que há um udpate disponível. Fui redirecionado para a página da Web e baixei o arquivo .deb. Eu cliquei duas vezes nele e deixei o gerenciador de pacotes ("Ubtunu Software") instalá-lo.
Agora, quando eu clico no meu atalho, parece que ele inicia a versão antiga e me retorna essa mensagem de atualização. Quando eu uso a busca da unidade, eu encontro 2 versões do programa. Um que pode ser meu atalho e outro que parece ser a versão mais recente (quando clico nele, a nova versão é iniciada).
Qual é o motivo para isso? O pacote foi atualizado ou o gerenciador de pacotes criou uma segunda instalação, em vez de reutilizá-la e atualizá-la?