Eu tenho meu laptop configurado para desligar no caso de uma tampa fechar (devido a toneladas de bugs com acordar no Ubuntu 16.04), mas toda vez que eu fechar minha tampa apenas ignora minhas configurações na ferramenta Tweak e só vai para dormir de qualquer maneira.
Não tenho certeza se isso está relacionado, mas quando o laptop acordar quando a tampa for aberta, ele voltará a funcionar automaticamente em ~ 10 segundos, mesmo que eu esteja digitando ativamente no teclado. Isso parece inevitável - não importa quantas vezes eu o acorde, ele volta a dormir até que eu o reinicie.
Estou usando o Gnome 3.