Toda vez que você executa o comando:
export PATH=$PATH:/path/to/php/bin-directory/
você modifica o ambiente no shell atual, ou seja, o programa executado na janela do terminal. Essa alteração não acontecerá com outras janelas do terminal (ou mesmo com outras guias no programa atual do terminal). Essa alteração não sobreviveria ao logoff / logon e / ou ao reinício.
Para tornar essa mudança persistente, veja a pergunta Como adicionar um diretório para o caminho?