Tem o mesmo problema com uma Radeon HD4250. O problema é que não existe um arquivo version.h dentro do diretório /lib/modules/4.4.0-47-generic/build/include/linux. Isso ocorre porque, nas versões mais recentes do kernel, o arquivo version.h foi realocado. Você pode localizá-lo com:
locate version.h
Como já sabemos qual versão do kernel e qual distro você está usando, basta vincular o arquivo ausente à pasta e iniciar a instalação novamente.
Fonte: Erro de instalação da placa gráfica Amd no ubuntu 15.10