Encontrei uma solução neste tópico: Ubuntu: "Inicializando em modo inseguro "com o SecureBoot ativado
Basicamente, este problema diz respeito à validação no módulo MOK (Machine Owner Key).
Para se livrar da mensagem, basta digitar:
sudo mokutil --enable-validation
Existe uma chance de que no Ubuntu 16 o driver pare de funcionar. Mas posso confirmar que no Ubuntu 14.04 - a funcionalidade cuda não é afetada. Eu não estava usando o driver para renderizar de qualquer maneira.
>>> sess = tensorflow.Session()
I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_gpu_executor.cc:900] successful NUMA node read from SysFS had negative value (-1), but there must be at least one NUMA node, so returning NUMA node zero
I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_init.cc:102] Found device 0 with properties:
name: GeForce 940M
major: 5 minor: 0 memoryClockRate (GHz) 1.176
pciBusID 0000:04:00.0
Total memory: 1.96GiB
Free memory: 1.94GiB
I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_init.cc:126] DMA: 0
I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_init.cc:136] 0: Y
I tensorflow/core/common_runtime/gpu/gpu_device.cc:755] Creating TensorFlow device (/gpu:0) -> (device: 0, name: GeForce 940M, pci bus id: 0000:04:00.0)