Acho que depende do seu hardware. Meu entendimento é que algumas mudanças nas entranhas de 16 romperam os drivers fornecidos pela AMD (fglrx). O driver de código aberto suporta apenas 2 canais através de HDMI. Existe um novo driver de origem da AMD, mas supostamente só funciona com o mais recente hardware Radeon.
Conversa / discussão na nVidia faz parecer que tem o mesmo problema. Eu suypposed isso pode deixar apenas Intel ou som não integrado como opções para multi-canal sobre HDMI no Ubuntu 16.
(Eu estou lutando a mesma batalha com um sistema AMD / Radeon)
Boa sorte!