Eu nunca usei o plugin aspera para funcionar corretamente com o Ubuntu 14.04, mas consegui fazer com que ascp
funcionasse. Funciona muito parecido com o scp, mas usa o protocolo aspera proprietário.
Depois de instalar o "plug-in Aspera connect", acesse ~/.aspera/connect/bin/
e digite ./ascp -h
para obter instruções de uso.
Eu sei que não é a resposta que você estava procurando. É apenas uma solução alternativa, mas na minha experiência, o cliente CLI é capaz de fazer tudo o que o cliente de desktop faz.
Disclaimer: Eu pessoalmente não entendo por que alguém usaria o aspera proprietário em vez de algo aberto como o "rsync", mas parece estar se tornando muito popular entre os recursos da web orientados biologicamente.